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NC文件读取及批量转为TIFF-史上最详细讲解-含代码(ArcGIS/MATLAB)

作者:欧阳逸时间:2024-03-24 10:06:25分类:伤感句子

简介  文章浏览阅读2w次,点赞67次,收藏379次。相信有好多遥感、地信、地理的同学经常会用到全球月均降水数据/气温等数据,而该类数据常以NC文件保存,大家拿到手后常常会迷惑,这是一种什么数据格式,如何读取,又如何转为我们熟悉的栅格数据。今天来为大家答疑解惑。Net

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何为NC文件,如何读取,如何批量转为TIFF(ArcGIS/MATLAB)

文章目录

前言一、NC文件的介绍二、查看NC结构三、读取NC3.1 ArcGIS读取3.2 Matlab读取 四、批量读取NC并保存成TIFF格式4.2 批量保存为TIFF格式4.3 导出结果验证 Ending


前言

相信有好多遥感、地信、地理的同学经常会用到全球月均降水数据/气温等数据,而该类数据常以NC文件保存,大家拿到手后常常会迷惑,这是一种什么数据格式,如何读取,又如何转为我们熟悉的栅格数据。今天来为大家答疑解惑。

一、NC文件的介绍

NetCDF全称为network Common Data Format,中文译法为“网络通用数据格式”;netcdf文件开始的目的是用于存储气象科学中的数据,现在已经成为许多数据采集软件的生成文件的格式。

一个Netcdf文件的结构包括以下对象:
● 变量(Variables) :变量对应着真实的物理数据;
● 维(dimension):一个维对应着函数中的某个自变量,或者说函数图象中的一个坐标轴;
● 属性(Attribute) :属性是对变量值和维的具体物理含义进行注释。

从数学上来说,netcdf存储的数据就是一个多自变量的单值函数。用公式来说就是f(x,y,z,…)=value;
●自变量x,y,z等在netcdf中叫做维(dimension) 或坐标轴(axix);
●value在netcdf中叫做变量(Variables)。

二、查看NC结构

使用MATLAB查看
●使用函数ncdisp
使用方法:
ncFilePath = [‘E:\个人文档1\项目\数据\2000-2020_tmp\tmp_2000_2002.nc’]; %设定NC路径
ncdisp(ncFilePath);
●读取结果
以下为该NC文件的结构,包含类型、维度、和变量;其中变量中又含有经度、纬度、时间、pre(这也就是我们需要的变量);
我们可以形象的理解为:经纬度是它的平面坐标,时间是它的维度,构成一个三维空矩阵,然后将pre分别填充到该矩阵中,就形成了这样的一个数据结构。
●注意:进行这一步操作,直白点就是看它的数据结构以及该文件的介绍,其次是为了确定维度和变量的名称,后续需要用到。
这里例如,经度的名称为lon,纬度的为lat,时间为time,变量为tmp.

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三、读取NC

这里分为两个软件来讲解,arcgis带有读取NC文件功能,但是仅能读取单个文件,如果数量够多,无疑消耗大量的时间,这里我们使用MATLAB进行批量读取并转换为TIFF。

3.1 ArcGIS读取

1.打开ArcGIS,点击工具箱,找到多维工具,点击下方的创建NetCDF栅格图层。

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2.弹出如下界面,输入netCDF文件,然后会自动加载如下变量,维度值可以选择time,然后在下面的表格time后面的值中填入相应的日期,即可加载你想读取的NC中某一时间维度的数据,不进行处理的话默认加载维度的第一个值。然后点击确认。
注意:注意该路径不能含有中文,否则不能自动加载以下变量,而且会报错。

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结果如下,即读取成功,保存栅格图层即可。
注意:但是这种方法只能导出一个时间点的栅格数据,nc一般都是多维度时间,那如何批量导出呢?接着看下面。

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3.2 Matlab读取

先读取任意一组维度的数据来看看,使用一下代码。设置一下自己的路径
clcclearncFilePath = ['E:\个人文档1\项目\数据\2000-2020_tmp\tmp_2000_2002.nc']; %设定NC路径ncdisp(ncFilePath); %查看NC结构data1=ncread(ncFilePath,'tmp'); 读取NC文件中的变量,注意要设置正确的变量名,该数据集变量名为tmp,怎么查看,参考上文开始的讲解data3=data1(:,:,1); %读取该数据集维度中的第1个时间序列数据
结果如下所示:可以发现data1显示7680471736,前面两个也就是我们说的经纬度,后面36也就是时间序列(该NC含3年数据,3*12月=36月),data3就是读取的2000年1月份的tmp数据。

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显示data3。选择data3,点击绘图工具,选择imagesc显示该数据,炸一看有点奇怪,仔细一看是一个鸡的形状(中国),但是它是显示的方向不对。应该先逆时针旋转90°,再镜像一下(翻转)。

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我们加上如下代码,一个是逆时针,一个是翻转。发现中国地形正常了。
 data4=rot90(data3); %逆时针旋转90° data5=flipud(data4); %矩阵的翻转 imagesc(data5);

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四、批量读取NC并保存成TIFF格式

MATLAB中将数据保存成TIFF格式牵扯到地理坐标系的问题。两种做法:一是利用Matlab中的georasterref函数来创建tif的地理坐标系,二是读取一个现成tiff文件,当做参考地理坐标系。由于第一种方法可能会出现偏移或者出错,为了保证数据的准确性,我们使用第二种方法。
同第三节的Arcgis读取操作,先读取NC中的某一期数据。然后定义投影,投影操作如下。

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查看属性,如果空间参考中有坐标系,即定义成功,如果定义了后还是没有,进行下一步操作。

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如图选中图层,右击选择属性,设定图层的坐标系。

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点击导出数据。将栅格数据集(原始)更改为数据框(当前),即可发现空间参考中有坐标系了,设置下保存路径,点击保存即可。

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保存成功后结果如下所示。

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4.2 批量保存为TIFF格式

1.废话不多说,直接上代码。将下面代码copy可直接用,需要调整的地方在文中已进行标注(需要调整),更改下文件路径即可,再有就是循环的地方,根据自己需求进行调整。

clcclear%%  导入NC数据集ncFilePath = ['E:\个人文档1\项目数据\2000-2020_pre\2000-2020\pre_2020.nc']; %设定NC路径**需要调整**ncdisp(ncFilePath); %查看NC数据结构%% 导入TIFF影像的坐标信息[A,R]=geotiffread('E:\li\pre_2018.tif');%该处路径为上述Arcgis中导出带坐标系的TIFF文件**需要调整**info=geotiffinfo('E:\li\pre_2018.tif'); %该处路径为上述Arcgis中导出带坐标系的TIFF文件 **需要调整**%% 读取pre数据data=ncread(ncFilePath,'pre');  %% 批量处理for year=2000:2020  %年循环**需要调整**        data1=data(:,:,1+12*(year-2000):12*(year-1999)); %得到每年的12个月数据。注意,第一个减去的时间与循环的起始时间相同,第二个减去的时间在起始时间的基础上减1。如该处的2000和1999。**需要调整**        data3=sum(data1,3)/12; %表示沿X轴的第3维求和,求年平均数据        data4=rot90(data3); %使矩阵逆时针旋转90°        data5=flipud(data4); %矩阵的翻转        filename=strcat('E:\个人文档1\项目\数据\NC_TO_TIFF\pre\year\中国',int2str(year),'年pre.tif'); %**需要调整**        geotiffwrite(filename,data5,R,'GeoKeyDirectoryTag',info.GeoTIFFTags.GeoKeyDirectoryTag);    for mon=1:12  %月循环        data2=data1(:,:,mon);  %读取月数据        data4=rot90(data2);%使矩阵逆时针旋转90°        data5=flipud(data4); %矩阵的翻转        filename=strcat('E:\个人文档1\项目数据\NC_TO_TIFF\pre\month\中国',int2str(year),'_',int2str(mon),'月pre.tif'); **需要调整**        geotiffwrite(filename,data5,R,'GeoKeyDirectoryTag',info.GeoTIFFTags.GeoKeyDirectoryTag);    endend

2.导出成功。

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4.3 导出结果验证

选取2000年1月份的结果,在ARCGIS中打开,发现数值在-32768-2339之间;在MATLAB中调出该期NC原始数据,提取最大最小值提取,可以发现和该数据99%接近,至于有细微的个位数误差,是由于将TIFF影像导入到ARcgis中进行了金字塔重采样。说明导出的结果是没问题的。

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Ending

好了,以上就是本次讲解的内容了,希望能给大家带来帮助,有问题也欢迎在下方留言探讨。

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